Το Ι.Ε.Μ.Κ. είναι ανοιχτό σε συνεργασίες με Ιδρύματα Τριτοβάθμιας Εκπαίδευσης σε Ελλάδα και εξωτερικό, με εθνικούς και τοπικούς φορείς πολιτισμού, με φορείς της Τοπικής Αυτοδιοίκησης, με δημόσια και ιδιωτικά αρχεία, με μουσεία, με μουσικά εκπαιδευτήρια κ.ά., με σκοπό την ανάπτυξη εκπαιδευτικών και ερευνητικών προγραμμάτων, τη δημιουργία κέντρου ψηφιοποίησης και τεκμηρίωσης μουσικών δεδομένων, την ανάπτυξη καινοτόμων τεχνολογικών λύσεων, τη δημιουργία πολιτισμικού δικτύου διαχείρισης της ελληνικής μουσικής κληρονομιάς, όπως και την από κοινού προβολή του ελληνικού μουσικού πλούτου από την αρχαιότητα ως τις σύγχρονες μουσικές εκφράσεις, μέσα από τη συμμετοχή ή/και διοργάνωση επιστημονικών και καλλιτεχνικών δράσεων & φεστιβάλ πανευρωπαϊκού/ μεσογειακού/ πανελλήνιου βεληνεκούς. Το Ι.Ε.Μ.Κ. έχει ήδη προβεί σε μνημόνια συνεργασίας με τους εξής φορείς:
• Εθνικό Κέντρο Έρευνας Φυσικών Επιστημών «Δημόκριτος»
• Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών (Ε.Κ.Π.Α.)
• Δημοκρίτειο Πανεπιστήμιο Θράκης (Δ.Π.Θ.)
• Εθνικό Τμήμα CIOFF® Ελλάδος
Το Ι.Ε.Μ.Κ. ήδη συνεργάζεται με τους παρακάτω πανεπιστημιακούς και αρχειακούς φορείς (βλ. και "Πραγματείες")
· το Εργαστήριο Εθνομουσικολογίας και Πολιτισμικής Ανθρωπολογίας του Τμ. Μουσικών Σπουδών του Ε.Κ.Π.Α.
· το Εργαστήριο Πολιτισμικών και Οπτικών Σπουδών του Τμ. Δημοσιογραφίας και Μ.Μ.Ε. του Α.Π.Θ.
· το Εργαστήριο Εφαρμοσμένης Μουσικής Ακουστικής και Ταλαντώσεων του Τμ. Τεχνών ΄Ηχου και Εικόνας του Ιονίου Παν/μίου
· το Εργαστήριο Οπτικής Ανθρωπολογίας: Εικόνα, Μουσική, Κείμενο του Τμ. Κοινωνιολογίας του Παν/μίου Κρήτης
· το Εργαστήριο Θεάτρου-Κινηματογράφου-
· το Ιστορικό Αρχείο Κρήτης
· το Τμ. Τεχνών Ήχου και Εικόνας του Ιονίου Παν/μίου
· το Τμ. Μουσικών Σπουδών του Παν/μίου Ιωαννίνων
· το Παιδαγωγικό Τμήμα Δημοτικής Εκπαίδευσης του Παν/μίου Αιγαίου
· το Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα Σπουδών "Αθλητικός Τουρισμός, Οργάνωση Δρώμενων, Χορός" του Τ.Ε.Φ.Α.Α. του Δημοκρίτειου Πανεπιστημίου Θράκης
· τον Τομέα Ιστορίας Νεότερων Χρόνων, Τμήμα Ιστορίας-Αρχαιολογίας, Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων
Ως ηλεκτρονική τράπεζα δεδομένων το Ι.Ε.Μ.Κ. προσκαλεί κάθε ενδιαφερόμενο, φυσικό ή νομικό πρόσωπο, που επιθυμεί, να καταθέσει ή να υποδείξει τεκμήρια, που αφορούν τη μουσική μας κληρονομιά, εμπλουτίζοντας έτσι την ηλεκτρονική αυτή τράπεζα.